Archív SAV vo vzťahu k SAV a organizáciám SAV vykonáva nasledovné činnosti:
- poskytuje metodické usmernenia a konzultácie organizáciám v súvislosti so správou registratúry,
- v prípade požiadavky pomáha aj so samotnou prípravou Návrhov na vyradenie registratúrnych záznamov z jednotlivých organizácií,
- vydáva stanoviská k návrhom registratúrnych poriadkov organizácií SAV a stanoviská k návrhom na vyradenie registratúrnych záznamov z jednotlivých organizácií,
- zabezpečuje manažment návrhov na vyradenie registratúrnych záznamov z jednotlivých organizácií a s tým súvisiacu komunikáciu s Ministerstvom vnútra SR na základe splnomocnení od riaditeľov organizácií SAV,
- preberá archívne dokumenty z činnosti SAV a organizácií SAV,
- sprístupňuje (nielen) pre potreby SAV alebo organizácií SAV dokumenty z ich činnosti, vyhľadáva dokumenty podľa požiadaviek, vyhotovuje ich neoverené, ale aj overené kópie,
- zabezpečuje správu registratúrneho strediska Úradu SAV,
- Archív SAV nevykonáva štátny odborný dozor u pôvodcov; ak ide o zriaďovateľov archívov podľa § 4 ods. 2 písm. b) Zákona 395/2002 Z. z. (t. z. aj SAV), vykonáva štátny odborný dozor Ministerstvo vnútra SR, ktoré prihliada vo vyraďovacom konaní na stanovisko Archívu SAV.